31 источник углерода, выбранный физиологами для анализа микробиологических сообществ, является международным исследованием биоразнообразия микроорганизмовБТипичный и авторитетный метод. Каждый.96 Эко.На доске есть 3 параллельных набора, каждая из которых имеет 31 источник углерода, 3 отрицательных контраста, после добавления одного и того же образца можно получить 3 набора параллельных данных. Характерное использование этих 31 источника углерода микробным сообществом называется метаболическими отпечатками пальцев микробного сообщества. Большой объем метаболической информации можно получить из отпечатков пальцев на отдельных микропластинах. Может использоваться для изучения функционального разнообразия микроорганизмов в чистой и смешанной флоре (например, образцы почвы).

Плата ECO, разработанная американской компанией BIOLOG, специально предназначенная для анализа микробиологических сообществ и экологических исследований, содержит 31 источник углерода, выбранный международными почвенными микробиологами для анализа микробиологических сообществ.

На каждой 96 - пористой пластине ЭКО есть три параллельных набора, каждая из которых имеет 31 источник углерода, три отрицательных контраста, и после добавления одного и того же образца можно получить три набора параллельных данных. Характерное использование этих 31 источника углерода микробным сообществом называется метаболическими отпечатками пальцев микробного сообщества. Большой объем метаболической информации можно получить из отпечатков пальцев на отдельных микропластинах. Может использоваться для изучения функционального разнообразия микроорганизмов в чистой и смешанной флоре (например, образцы почвы).

31 источник углерода можно разделить на шесть основных категорий:

Моноза / гликозиды / полимерные сахара

B2, D - лигоза

H1, а - D - лактоза

A2, ? - Метил D - глюкозид

G2, Глюкоза - 1 - фосфаты

E1, а - циклический декстрин

F1, Гепатоза

G1, D - фибродимоза

Аминокислоты,

A4, L - аргинин,

B4, L - аспарагиновая кислота

C4 L - фенилаланин

D4, L - серин

E4, L - сульфин

F4， Глицидин - L - глутаминовая кислота

Эфиры

B1, Метаболит пировиноградной кислоты

C1, Твен 40

D1, Твен 80

A3, D - галактоновый гамма - эндотерин

Алкоголь

С2, I - альгинозол

D2, D - гликоль

H2, D, L - а - глицерин

Амины

G4, Бензоэтиламин

H4, Гуминоамин

E2, N - ацетил - D - виноградамин

Кислоты

B3, D - галактоза

F2 D - аминокислота глюкозы

C3, 2 - гидроксибензойная кислота

D3, 4 - гидроксибензойная кислота

E3, R - гидроксимасляная кислота

F3, Иконновая кислота

G3, а - бутадиеновая кислота

H3, D - яблочная кислота

После простой обработки образца (фильтрации или центрифугирования) взять очищающую жидкость и добавить ее на пластину ЭКО для культивирования в течение более 5 дней, измерять значения OD при 590 нм и 750 нм с помощью энзимометра с интервалом времени, микроорганизмы, реагирующие на величину OD, используют способность определенного источника углерода, чтобы экспортировать значения OD для анализа, например, значения AWCD (средняя абсорбция), изобилия, динамический анализ одного отверстия, сравнение различных источников углерода и т. Д. И использовать программное обеспечение для кластеризации для кластерного анализа различных образцов.

Стоит отметить, что пластина ECO не только измеряет культивируемые микроорганизмы, но также может измерять некоторые не культивируемые микроорганизмы, до тех пор, пока микроорганизмы могут метаболизировать (не размножаться) с использованием источников углерода, цветовая система на пластине ECO может быть обнаружена.

Чаще всего используются пластины ЭКО для анализа воздействия факторов окружающей среды, корней, листьев, удобрений, пестицидов на разнообразие экологических функций почвенной микрофлоры, для сравнения различий в функциональном разнообразии между различными продуктами или образцами в разное время, для сравнения различий в функциональном разнообразии микробных сообществ до и после восстановления окружающей среды и т.д.